肺癌甲基化数据分析
肺癌是一种起源于肺部支气管黏膜或腺体的恶性肿瘤,是全球范围内最常见的癌症之一。甲基化的分析流程,主要识别和量化基因组中甲基化位点的变化,通常发生在胞嘧啶(C)上,特别是在CpG二核苷酸中,包括了质控、去接头、比对参考基因组、差异碱基化区域的筛选以及对应的注释。其中比对涉及到两种方法bismark和bsmap。本产品还包括了结合转录组的数据进行联合分析和结果可视化。
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挂牌时间:2024-07-24
淋巴瘤数据分析
淋巴瘤是一种源于淋巴组织的恶性肿瘤,包括霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤两大类型。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
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胶质瘤甲基化数据分析
胶质瘤是一种源自脑内神经胶质细胞的肿瘤。甲基化的分析流程,主要识别和量化基因组中甲基化位点的变化,包括了质控、去接头、比对参考基因组、差异碱基化区域的筛选以及对应的注释、结合转录组的数据进行联合分析和结果可视化。其中比对的方法涉及到两种方法bismark和bsmap。
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间皮瘤数据分析
间皮瘤是一种罕见的恶性肿瘤,主要影响身体的浆膜层,尤其是胸膜和腹膜。间皮瘤与长期接触石棉有关。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
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挂牌时间:2024-07-24
胰腺癌数据分析
胰腺癌是一种起源于胰腺导管上皮及腺泡细胞的恶性肿瘤。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
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挂牌时间:2024-07-24
乳腺癌数据分析
乳腺癌是发生在乳腺上皮组织的恶性肿瘤,发病率在不同国家和地区之间存在显著差异,欧美的发病率较高,亚非较低。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
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挂牌时间:2024-07-24
结直肠癌数据分析
结直肠癌,是发生在结肠或直肠的恶性肿瘤。它是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率均较高。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
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转座子可及染色质数据分析ATAC-seq
转座子可及染色质测序分析(ATAC-Seq)用于研究基因组中的开放染色质区域。本产品包括了质控、去接头、比对参考基因组、peak的确认、转录起始位点的筛选以及对应的注释、结合转录组的数据和Chip-seq的数据进行联合分析。本产品可应用于鉴定开放染色质区域、转录因子结合位点分析、单细胞ATAC-seq。
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挂牌时间:2024-07-24